木材本身也是影响木材防腐剂有效性的重要因素——木材的心材与边材:
如之前所述,处理木材心材和边材难易程度大不相同。例如,南方松树和树苗易于处理,心材难以处理。同样,欧洲红松和樟子松的边材易于处理,心材难以处理。而辐射松,边材易于处理,心材更容易处理。因此,心材与边材的百分比是决定其是否适合作为防腐木材的因素。为此,防腐蚀工业通常将木材分为木材和心材。
带有大边材的木材称为边材树种。具有宽心材和窄心材的树被称为心材树种。例如,如南方松、马尾松的边材较宽,属边材树种。欧洲雪松,樟子松和落叶松具有狭窄的边材,是心材树种。虽然名称不正确,但有些人熟悉将边材树种易于处理的物种,以及作为难处理物种的心材物种。